每一種高深的技藝和文化，都會衍生出諸多流派，比如古時候的諸子百家，中醫學有補土派和滋陰派等等，我們的紫微斗數在發展歷程中，也曾出現過許多的派別，比如三合派、四化派、河洛派，以及比較出名的沈氏紫微算命術，等等。
一、三合派
三合派（南派）比較出名的一個派系即洛陽中州派，該派系的主要創始人為白玉蟬和吳景鸞，口述傳承，直到王亭之時期，才撰寫了《紫微星訣》，并且正式命名為中州派，至此才得到正統傳承。三合派紫薇算術，重星曜星情而輕宮位結構，他們認為分析紫微命盤時，星曜的意義至關重要，指向更關鍵，宮位框架次要分析。中州派對紫微斗數一百多顆星曜的研究也更加透徹。
二、四化派
四化派（北派）與三合派呈南北對立的局勢，在論命法則、占星技術、流年歲運之推算，以及天象占星等方面，南派與北派都差異明顯，二者平分秋色，各有優勢。南派重星曜而輕宮位結構，北派則重宮位結構而輕星曜，分析命盤時，先看宮位架構，其次看星曜化氣，最后才是星曜多少。
三、現代科技派
相較于幾千年的封建時期來說，現代科技文化新思想的沖擊，在漫漫歷史長河中幾乎是絕無僅有的，紫微斗數算命流派也衍生出一個新的分支——現代科技派。借助大數據和現代技術，以及心理學研究知識，結合古老的算命實用科學，更加提高了推算的準確性，提倡樹立正確的造命觀。
四、華山秘儀派
除了主要的對立流派南派和北派之外，還有許多特殊流派，比如華山秘儀派、沈氏紫微派等。華山秘儀派發源地在臺灣，影響極深，著名大師方無忌、法堂主人等名人思想，皆有華山秘儀派的影子。華山秘儀派注重四化和宮位結構之間聯系，該流派秘籍《欽天四化紫微斗數飛星秘儀》曾經拍賣出數十萬高價，另有著作《先天四化飛星命譜》、《梅花易數》等。
雖然紫微斗數算命流派百花齊放，但是只要遵從命理學推斷原則，理解透徹斗數理論，最終得到的推算結果自然準確，各流派的推算技藝、論命原則雖不相同，但也是萬變不離其宗。