據臺灣中時新聞網報道，孫中山先生的歷史與事跡數十年來仍有許多疑點，其中有關孫中山先生的死因與遺體去向，坊間仍有許多傳聞與未解之謎。
孫中山去世時，黨內元老胡漢民在海內外發起籌建中山紀念堂計劃，在大陸各地建立孫中山紀念堂。其中北京與廣州的中山紀念堂曾聯合舉辦孫中山文物展，除展出孫中山生前照片與使用器物，還有相關檔案文件。其中部分文件透露了一些與過去外界所知的歷史有些出入，例如孫中山的真實死因與其遺體內臟的解剖標本去向。
臺灣的歷史教科書中一般稱孫中山死于肝癌，一般的文史記載也是如此，這是因為他到北京協和醫院時被診斷罹患肝癌，并為此進行了手術。但據協和醫院保留的孫中山病歷文件顯示，孫中山罹患肝癌并非其原發病癥，肝臟的癌細胞是由膽囊癌和胰腺癌轉移而來。
孫中山去世后，遺體葬于南京中山陵，但后來因日軍侵華，孫中山遺體也經歷不少風波。最初日軍攻下上海往南京進發時，“國民政府”擔憂陵墓遭破壞，原打算開墓取出孫中山棺柩與遺體，但亦擔憂墓葬打開仍會傷及棺柩與遺體，最后決定保留不動。日軍進攻南京時，陵園內建筑有部分受到炮火破壞，所幸陵墓棺柩未受波及。由于孫中山在日本有相當威望，日軍未再進一步破壞中山陵園。
孫中山在北京協和醫院去世時，各方都認為應當進行遺體防腐保存，內臟則取出火化。但在日本占領協和醫院后，意外發現孫中山的內臟切片和臘塊標本，才知院方未將內臟火化，而是保留供研究之用。后來日本扶植的汪精衛偽政權向日本要回了這些切片標本，原欲大張旗鼓地將之歸葬中山陵，卻被上海醫院以研究為名借走。抗戰勝利前夕這些內臟切片標本又被偽政權官員偷出私藏，還以此要脅“國民政府”以求保命，最后在蔣介石嚴令之下終于追回標本切片，以及附帶的一盒臨床紀錄照片。這些對象原打算存放中山陵，但后來傳言是在1949年由南京撤退時，由孫科帶走。
“國民政府”撤退至臺灣前兵荒馬亂，當時《中央日報》則發布消息，指稱孫中山流落在外的內臟標本再次被盜，但據孫中山生前貼身衛士范良曾表示，他曾下到墓室內仔細看過，“我下墓穴揭開玻璃罩，打開紅布擋著的五只玻璃瓶，上面寫著孫中山先生五臟切片標本”。由于相關當事人皆已去世，孫中山遺體標本是否保存在中山陵或已其后代保管，仍需歷史研究者努力發掘真相。
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