白細胞與血小板上與有A、B、H、MN、P等紅細胞抗原，此外還有它們所特有的抗原，這些抗原具有臨床意義，特別是組織相容性抗原對選擇器官組織的移植和血液成分的輸注的合適供應者(donor)有重要意義。白細胞與血小板的抗原可使受者（recipient）產生免疫反應，這時，輸血可引起發熱反應，移植的器官組織受破壞的速度加快，在體內的生存期縮短。
人白細胞抗原是人類白細胞上最強的同種抗原。ＨＬＡ系統由數量眾多的抗原所組成，是一個極為復雜的抗原系統，控制這些抗原的基因位于第６號染色體的短臂上，在這一部位的染色體上分布著A、B、C、D４個基因位點，它們控制著７組HLＡ抗原即：HLA-A、HLA-B、HLA-C、HLA-D、HLA-DR、HLA-DQ和HLA-DP，每一組又包括許多種抗原。例如HLA-A組有20多種抗原，HLA-B組有50種以上不同的抗原，HLA-C組則有11種抗原。根據抗原發現的順序，又對抗原作編號，如HLA-A1、A2……A19等。它們的數量隨著新抗原的認定還在繼續擴大。
HLA是鑲嵌在細胞膜上的糖蛋白，根據HLA的結構和分布特征，將它們分成兩類：即I類和Ⅱ類抗原，HLA-A、B、C屬I類抗原，分子量為56000，由一條重肽鏈和一條輕肽鏈所組成，它們的抗原特異性是由重肽鏈上氨基酸列所決定的。這類抗原總稱為I類抗原；它們除了分布在白細胞和血小板上，還廣泛分布在各種正常組織器官和腫瘤組織的有核細胞膜上。其余的HLA抗原即D、DR、DP和DQ屬于Ⅱ類抗原，分子量為63000，它們只分布在B細胞、巨噬細胞、單核細胞和內皮細胞上。
HLA系統除了在醫學上與器官移植、植皮、骨髓移植和輸轎有密切的關系外，還可應用于親子鑒定和人類學研究。在應用于親子鑒定時，由于HLA的數目極多，HLa–A和HLA-B相結合的形式極多，要有相同表現型的機會極少。例如，15個HLA-A和20個HLA-B能夠產生20246種表現型。因此，在作親子關系的否定判定時，HLA測定可過到90%以上的可靠性。各種HLA出現的頻率具有明顯的種族差異。例如，高加索人種中，HLA-A-A30和B42抗原的出現頻率較其它人種為少，而在北美印地安人種，HLA-B51抗原出現頻率較高。因此，HLA系統是人類學研究的一個重要指標。
血小板還有一些特有的抗原，如PI、Zw、Ko等系統，它們與紅細胞或白細胞上的同種抗原沒有關系。這些抗原可因輸血和妊娠而產生免疫抗體。約有50%的病人在長期重復輸注血小板后，在血清中可出現抗輸入血小板的抗體。它們可引起發熱反應，使輸入的細胞縮短生存期，還以掩蓋抗紅細胞的特異抗體的存在，因而影響血型測定的正確性。當妊娠母親血清中出現抗血小板抗體時，可導致新生兒血小板減少癥。
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