石榴和其他食物一樣也是可以放進冰箱中保存的，低溫能緩解水果的腐敗變質，起到短時間的保鮮，但是不適合長期保存。放冰箱保存的話，完整的石榴可以保存2-3周左右，如果是已經剝開的石榴最多可以保存3天左右。
放冰箱保存時需要注意，石榴是溫性水果，比較適合的保存溫度是2-3度，不超過5度，濕度85/100的環境下保存，而一般的直立式冰箱冷藏室溫度可以控制在5-15度之間，基本能達到石榴的保鮮要求的。
石榴量不大可以將室內預冷過的石榴放入聚乙烯塑料袋中，扎緊口袋放于涼爽通風的室內。用這個方法儲藏石榴可以長達140天，石榴仍然新鮮。如沒有聚乙烯塑料袋，也可以用普通塑料袋將經過殺菌的石榴單個包裝，儲藏在3～4℃的環境下，這樣保存100天果實也能保持新鮮。
如果石榴量大，可以將通風良好且陰涼的房間打掃干凈，在地面適量灑些水保證室內濕度。然后在地面鋪上一層5厘米左右的稻草，再往上擺一層石榴，之后再鋪一層稻草，層層疊放。方法需要每隔15～20天檢查一次，將變質石榴拿出，然后更換稻草。這樣保存的石榴能存至翌年四五月份。
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