新買的笛子要用鹽水、植物油保養，新買回來的笛子或自己新制作的笛子，如果發現竹質不太干，可將笛子所有洞孔堵塞住，然后灌進點鹽水，泡浸1-2天然后打開洞孔將鹽水倒出，稍用清水沖洗，待一小時后，再在筒內涂些熟的植物油就可以了。
如果買回來的笛子本來竹質很干而又堅固，最好用酒精擦洗一下笛筒和吹孔的周圍，以達消毒之目的。另外竹內的少許水份也會隨酒精的揮發而排除。
大家平時在吹完笛子的時候，要把笛子放進笛盒里。一般專業吹笛的人，都有一個笛盒，沒有盒的人，可做一個布套，最好做一個寬的，一個窄的，寬的夏天用，窄的冬天用，平日將笛子放在里面。如果這些都沒有，可找一塊干凈的布來包住，以免風吹日曬，灰塵進入。
笛子一般在吹完之后，一定要將笛筒內的口水倒出來。最好做一個布刷，口水倒出后，捅進去輕輕一擦，然后裝入盒或袋內。以免口水在笛筒內發霉發臭，以至笛筒腐爛。
笛子吹久了，笛筒內慢慢會有許多灰塵。灰塵加之氣水的浸透，久而久之結成了污垢，這不但不衛生，常常發出臭味，甚至要影響音色、音準。大家可以用軟布或藥棉等，捆纏在木棒上，浸酒精之后擦洗笛子。
