中國圍棋和日本圍棋不一樣。中國圍棋和日本圍棋的勝負規則不一樣，中國大陸采用數子法，規則規定計算勝負時用數子法，活子和活子圍住的空都算，黑方先行貼3.75子；而日本采用數目法，日本規則規定計算勝負時用比目法，只算空和對方的死子，終局黑方減6.5目。
中國圍棋和日本圍棋的棋子不一樣，日本因為平時生活習慣跪著，所以圍棋大多采取棋墩，棋子采用雙面鼓式。從上面俯視，棋子比較有立體感。中國因為圍棋使用的是棋盤，而且多為坐式，所以棋子采用平底棋子。
中國圍棋和日本圍棋的起源不一樣。中國圍棋起源于中國古代，確抄切年代在公元前2356年左右，稱為“弈”；日本圍棋是日本古代著名學者吉備真備在唐留學二十年后，于公元735年帶回日本的。
在奈良時代的時候，圍棋在日本宮廷盛行起來。專門保存古物的奈良正倉院就存有圣武天皇（724-948）使用過的棋局。日本史書《續日本紀》中也有如下記載：公元738年宮中有二人名曰大伴宿彌和連東人者，于政務之閑對弈，爭論中宿彌以刀砍殺東人。值得一提的是，此時已出現職業棋師，并出入于宮中了。
