歷史上皇太極一共有26個孩子，其中有11個兒子，15個女兒，其中一個女兒為養女。在他死后，由他的第九子愛新覺羅·福臨繼承皇位。
女兒：
長女：敖漢固倫公主，母繼妃烏喇那拉氏，嫁蒙古敖漢部郡王班第。
次女：固倫溫莊長公主，名馬喀塔，母孝端文皇后，先嫁蒙古察哈爾部林丹汗之子額哲，再嫁額哲弟阿布奈。
三女：固倫靖端長公主，母孝端文皇后，嫁蒙古科爾沁部奇塔特。
四女：固倫雍穆長公主，名雅圖，母孝莊文皇后，嫁蒙古科爾沁部弼爾塔哈爾。
五女：固倫淑慧長公主，名阿圖，母孝莊文皇后，先嫁正黃滿洲旗人索爾哈，再嫁蒙古巴林部色布騰。
六女：固倫公主，母側妃博爾濟吉特氏，嫁滿洲旗旗人夸札。
七女：固倫淑哲公主，母孝莊文皇后，嫁鑲黃滿洲旗旗人喇瑪思。
八女：固倫永安長公主，母孝端文皇后，嫁蒙古科爾沁部巴雅斯護朗。
九女：母側妃博爾濟吉特氏，嫁博爾濟吉特氏哈尚。
十女：縣君，母庶妃納喇氏，嫁滿洲旗人瓜爾佳氏輝塞。
十一女：固倫端順長公主，母懿靖大貴妃，嫁博爾濟吉特氏噶爾瑪索諾木。
十二女：鄉君品級，母氏闕，嫁博爾濟吉特氏班第。
十三女：母庶妃納喇氏，嫁滿洲旗人瓜爾佳氏哈拉。
十四女：和碩恪純長公主，母庶妃察哈爾奇壘氏，嫁吳三桂之子吳應熊。
養女：（1615-—1637），生父克勤郡王岳托，生母嫡福晉哈達那拉氏，封和碩公主，額駙翰卓禮克圖巴敦臺吉。
兒子：
皇長子：愛新覺羅·豪格，生母繼妃烏拉那拉氏。
皇二子：愛新覺羅·洛格（1611—1621），生母同皇長子，幼殤。
皇三子：愛新覺羅·洛博會（1611—1617），生母元妃鈕祜祿氏，幼殤。
皇四子：愛新覺羅·葉布舒（1627—1690），生母庶妃顏扎氏，初封鎮國將軍。康熙8年，晉封輔國公。康熙二十九年（1690年）九月二十二日，葉布舒病死，享年64歲。
皇五子：愛新覺羅·碩塞（1629—1654），又名碩色，號霓庵，清朝宗室，滿洲鑲紅旗人，生母側妃葉赫那拉氏，承澤裕親王。
皇六子：愛新覺羅·高塞（1637—1670），生母庶妃納喇氏，鎮國愨厚公，康熙九年07月22日子刻卒，年34，謚愨厚。著有恭壽堂集。滿族詩人。久居沈陽，淡泊出世，好書畫，精通樂理，善彈琴，有詩集《恭壽堂詩》一卷。
皇七子：愛新覺羅·常舒（1637—1699），生母庶妃伊爾根覺羅氏，初封鎮國將軍。康熙八年晉輔國公，十四年削爵，三十七年授輔國公，康熙三十八年逝世，年63歲。
皇八子：未命名（1637—1638），生母敏惠恭和元妃科爾沁博爾濟吉特氏，幼殤。
皇九子：愛新覺羅·福臨（1638—1661），生母孝莊文皇后科爾沁博爾濟吉特氏，清世祖章皇帝，年號順治，在位十八年。
皇十子：愛新覺羅·韜塞（1639—1695） ，生母庶妃克伊克勒氏，初封三等鎮國將軍，康熙八年晉輔國公。康熙三十四年（公元1695年）二月初九卒。
皇十一子：愛新覺羅·博穆博果爾（1642—1656），生母懿靖大貴妃阿霸垓博爾濟吉特氏，順治十二年（1655年）封襄親王， 順治十三年（1656年）去世，謚號襄昭，無嗣。
