明朝的首度叫應天府和順天府。明朝共有兩個首都，一個是朱元璋定下的首都應天府，也就是南京，一個是后來朱棣即位后將首都遷到順天府，也就是北京。
朱元璋稱帝之后，以應天府（南京）為京師，國號大明，年號洪武，而朱元璋之所以將南京選做首都，一是可能因為南方相對于北方來說比較穩定，二是南方的經濟比較發達，可以為朱元璋四處征戰提供經濟基礎，三可能就是一些風水方面的原因了。隨后朱元璋一路征戰，攻占了元大都也就是現在的北京，徹底結束了蒙古在中原的統治，然后繼續出戰，直至天下初步穩定。
朱元璋駕崩之后，太子朱標早死，由皇太孫朱允炆即位，欲鏟除朱棣，朱棣在姚廣孝的建議下以“清君側，靖內難”的名義起兵，最后率軍南下，攻占南京，史稱靖難之役。朱棣即位之后，將北平改名北京，然后遷都北京，這就是明朝的第二個首都，此后，明朝也一直將北京作為首都。
