秦檜的兒子是憂思過重而亡。秦檜病重期間，皇帝罷免了秦檜和兒子秦熺的官職，風光一時的秦熺失去權力后郁郁寡歡，在紹興三十一年一命嗚呼。
歷史記載秦檜無子，秦熺本是他的內侄，被夫人王氏所收養，遂認為己子，也就是養子。秦檜本不喜歡這個養子，但王氏比秦檜還要陰險毒辣，秦檜不得不替養子謀取利益。后來秦檜知道自己已經是將死之人，于是就給養子秦熺鋪好了后路，讓秦熺的從官之路得到晉升，意圖子承父業。無奈秦檜的罪行已經被人們看的很清楚，最后皇帝在秦檜將死的時候，處理了秦檜與他的兒子。
秦檜的妻子王氏，終身未給秦檜生過一個兒子。野史中記載秦檜早年與婢女私通，生下一子，他害怕王氏責罵，將兒子送與福建一戶姓林的人家。就有了秦檜真實的兒子姓林一說，但這一說法并沒有得到真實。
