神明廳的神桌、神像上難免會積些灰塵，有時香灰也會掉落在桌面上，但清理神桌有不少禁忌，讓大家都不敢大意，光是「什么時候可以清理神桌」這個問題就常讓大家頭痛了。
首先，大家都知道每年歲末、春節前，農歷十二月二十四日為送神日，送神明回天庭放寒假后，便可幫自家神明廳大掃除，除了基本的環境清掃，神龕和祖先牌位也須用刷子或抹布仔細清理，將祖先牌位、神像上的灰塵和香灰刷除，但要注意神尊不可用水清洗，且刷子、抹布不可以刷過、擦過神明的眼睛，此稱為「清屯」。清屯時神像可以移動，其他時間則盡量不要移動神尊，除非有特殊原因且有專業人士在場指導。
另外，每個月農歷初一、十五，也可以簡單整理香支，拿掉過多的香支，神桌上的灰塵、香灰也可以簡單清掃，盡量避免動到神尊。但不管是年前的大掃除還是初一、十五的簡單整理，有兩大重點要特別注意，不可動到香爐，香爐的位置都是有看位置安放，且有一說法認為香爐代表家中的財庫，若隨意移動，位置錯了會連帶影響到家運；此外，整理神龕時，盡量避開有外人在的時候，最好是只有家中成員時再清掃整理，不讓外人看到家中神明不干凈的樣子。打掃前，也別忘了先上香跟神明稟告，請他們可以注意并且回避一下。
