由于不科學的引種、連作和栽培措施不當等引起的。紅薯長黑皮的現象也叫甘薯黑斑病，主要浸染塊根皮層，發病初期薯塊表皮形成淡褐色小斑點，然后逐漸擴大形成灰黑色和黑色不規則大病斑。
紅薯貯存時候需要注意，早中熟品種8月底9月初開始收獲，遲熟品種10月中旬開始收獲。最遲收獲期在降霜之前。禁止雨天收獲。收獲時要輕挖、輕裝、輕運、輕卸，防止薯皮和薯塊碰傷。貯存要求溫度在10-15℃，空氣相對濕度在85%-90℃，貯存場所應清潔衛生，做好防鼠、防毒工作。同時要有保溫措施，防止凍傷和擠壓，并注意通風散熱。
紅薯怕冷，當溫度過低時可能受凍，形成硬心，蒸不熟、煮不爛。如果溫度長期高于攝氏十八度以上，又會生芽。儲存紅薯最好把室溫掌握在攝氏十五度左右，也要注意防止溫度忽高忽低。紅薯受了潮濕，很容易引起病菌侵害，造成腐爛。
紅薯儲存時最好放在透氣的木板箱內。如果沒有木箱，在堆放紅薯的地方和靠墻處，應墊上木板，薯堆上再蓋些東西，以防受潮經濕。在溫暖的白天里，要適當打開窗口換換氣，以保持室內空氣新鮮，但要防止冷風吹入。
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